已经升到了初中，同时也通过自己建立的一部分情报渠道，得知了自己未来可能要面临的安排。
“大叔，我可能要离开一段时间了。”碇真嗣和蓝诺告别，虽然还没有收到来自父亲的来信，但他却已经从自己的情报渠道，得知了自己很可能是初号机的适格者，而他母亲的灵魂很可能就被困在初号机之中，成为驾驶员也可以直接深入到nerv内部，调查事件的真相，他是绝不会放弃这个机会的。
和原本的剧情相比，现在的这条历史线已经彻底面目全非，碇源堂虽然知道一些碇真嗣早期弄出来的动静，毕竟那时候碇真嗣虽然解开了基因锁，但受限于自己的年龄，思维没那么缜密，还是留下了一些蛛丝马迹的。
但随着年龄的增加和经验的丰富，他所建立起来的情报渠道已经越来越隐秘，甚至于他已经摸清楚了在自己身边保护监视自己的究竟是哪些人，是哪个同学，哪个老师，小区中的哪个住户，都被他摸得一清二楚，以至于碇源堂在最近的这两年，其实对自家的儿子真实的情况是完全失去了掌控的。
也并不清楚，自己家的熊孩子究竟在外面搞出了多大的动静，有多大能耐？烁
而就如同是碇真嗣所预料的那样，没过多久他就收到了来自父亲的来信，要求他在学校附近等待一个深蓝色头发的女人去接他。
关于这位上尉的身份，碇真嗣也已经有了一定的了解，她是nerv年轻成员之中，军衔最高的一个，拥有极高的指挥权，能够获得现在的地位，依靠的是在战术指挥方面的真才实学。
除此之外，碇真嗣甚至调查过有关于这位上位的私人生活，得知这是一位比表面看起来要邋遢的多的女性，曾经有过一段恋爱，而对象则是一个身份相当敏感的男人，似乎是某个组织的间谍，但又没有那么简单，很难判断他究竟是几面间谍。
虽然在见面之前已经了解了这么多情报，但在看到远方巨大的使徒出现，并且朝着第三新东京市的方向前进的时候，碇真嗣还是感到了巨大的震撼。
他的调查虽然还没有深入到发现死海文书的程度，但其实对最近可能会有使徒袭击，还是有
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