亲政之后，很可能通过替换共治者，把她彻底逐出最高权力层。因此，太后的反应才会如此激烈。
再之后，巴西尔三世在重臣们的拥护下，驱逐了太后，掌握了权力。随着他不断获得军功和权威，也开始着手对制度继续进行调整。
到这个时候，紫帐汗国的行政机构已经比较完善。而经过三四代人的传承，一些世侯家族已经走向了衰落甚至瓦解。
当行省、军区的调整完成之后，世侯们已经不再拥有严格意义上的领地，大汗自己直辖的农牧区也被拆分成了军府。无论是南衙世侯，还是北衙的万户，都开始更多地作为官员存在，而不是原先那种领主和部落头人。
在这种情况下，巴西尔再次对席位做了调整，按照职务来授予席位。两名巴塞琉斯和一名教会代表，没有进行改动，其他职务则进行了大幅调整。
汗国中央，一直在模仿塞里斯，设立六部对国家进行管理，并按照东罗马习惯，对名称和管辖范围进行了一些改动。
由于早年就留下的习惯，紫帐朝廷下没有吏部，而是由宰相府直接管理日常事务，由忽里勒台元老会议批准和任命官员。“罗马宰相”本人，也是这十三人中的一员。
而另外五个大部的首领，也就是财户尚书、礼部尚书、军务尚书、大法官和水部尚书，虽然平时在丞相之下，但也一人占一个席位。
此外，军务尚书只负责平日里的征兵、训练、补给等军政工作。战时指挥，是将领们的工作。这些将领们的顶头上司，或者说在朝廷里的代表，分别是南衙元帅和北衙元帅。这两人再加上海军大公，同样各占一个席位。
最后一个席位，则是灵活的。按照约定，摆赛汗每六年会选择一名高官，授予他这个位置。大部分时候，是授予邮驿尚书或者宫廷总管，有时候还会特别留给其他官员，或者重要地区的行省总督。
比如安条克那边，刚收复的时候，担任总督的李化文就意外被巴西尔选入了十三人议会。但后来，六年没到，他就升了官，调回大都，结果反而被从议会里踢出去了……
这样的用意，大概是为了留出余地，协调各个势力之间的平衡。从结果看，应该也有鼓励其他部门积极工作
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