隋朝后军仍然有数万人，高句丽跟随抄击，最后的羸弱的数千隋朝尾军，被高句丽杀掠。而杨玄感的叛乱被迅速平定。
隋炀帝第三次亲征高句丽，是在大业十年，隋炀帝下诏再次征发天下兵，攻打高句丽。三月，隋炀帝到达涿郡，隋军士卒在路上逃亡相继。隋炀帝到临渝宫祭黄帝，斩杀叛军者以衅鼓，仍然无法阻止人们逃亡。七月秋初，隋炀帝车驾到达怀远镇。这时候，隋朝国内已经大乱，所征之兵多数未能按期到达，隋朝来护儿向平壤进军，高句丽王高元害怕，于是遣使请降。隋炀帝非常高兴，遣使召来护儿率军返回。高句丽的请降，却并非真正归附，只不过是诈退隋军的一种缓兵之计。而“自负才学”的杨广，对此却未能识破，竟下令班师还朝。
大将来护儿认为此时正是攻破高句丽的好机会，想继续进攻，不肯奉诏，但是诸将听从隋炀帝的命令，都请返回，来护儿才奉诏退军返回。
隋炀帝对高句丽发动的战争，连年征战使数百万人丧生，过度残暴的征敛与统治引起国内人民对隋炀帝的强烈不满。隋炀帝第一次攻高句丽时，就开始爆发隋末农民起义。至隋炀帝第三次征高句丽，各地大量农民起义使隋朝统治崩溃、名存实亡。
十月，丁卯，隋炀帝到达东都，己丑，到达西京。征高句丽王高元入朝，高元却没有来。隋炀帝下令将帅严装，准备再次征讨高句丽，最后没有成行。
在隋炀帝第三次征讨时，高句丽王表面上表示臣服，但是却不按隋炀帝的命令入朝，还俘获大批隋人不放还，后世中原人到高句丽，“隋人望之而哭者，遍于郊野”。
隋炀帝征高句丽，结果高句丽还在，隋朝却大乱灭亡，北周留下的丰厚遗产被败坏殆尽。隋炀帝造成的大乱严重削弱了华夏，导致人口锐减到200余万户，还留下严重分裂内战，连吐谷浑都返回故地还攻打隋朝河右，隋朝郡县却防御不了，而**厥崛起达到“戎狄炽强，古未有也”的极盛程度，突厥可汗将隋朝中原的部分地区纳入势力范围，突厥可汗还想效法拓跋道武帝取得中原，华夏面临被突厥灭亡的危险。隋炀帝征高句丽，结果华夏被大乱严重削弱，对华夏的破坏远大于对高
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